Отделение физиотерапии и водолечения использует широкий диапазон физиотерапевтических методов для лечения детей 12 клинических отделений круглосуточного пребывания, дневных стационаров, детей и подростков-спортсменов.
В структуре отделения имеются кабинеты электролечения, светолечения, электросна, ингаляторий, водолечебница, а также кабинеты с мультисенсорными реабилитационными установками «San-spectra 9000», «Spa Jet Dermalife»,»Wellsistem Relax».
Тяжёлым больным процедуры отпускаются непосредственно в палатах.
Использование лечебных физических факторов в комплексной терапии различных заболеваний позволяет воздействовать как на основные, так и на сопутствующие заболевания, удлиняя период ремиссии после перенесённых заболеваний у детей и укорачивая сроки пребывания на стационарной койке.